Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpr55Q3UJF0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms