Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5113Q3UGK8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5113Q3UGK8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms