Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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