Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q3U6N9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms