Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms