Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Prr27Q3SYJ2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Prr27Q3SYJ2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Prr27Q3SYJ2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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