Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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Shroom4Q1W617 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms