Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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