Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Tdrd9Q14BI7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Tdrd9Q14BI7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd9Q14BI7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Tdrd9Q14BI7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Tdrd9Q14BI7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Tdrd9Q14BI7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd9Q14BI7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms