Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms