Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spata18Q0P557 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms