Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms