Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms