Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms