Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms