Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a2Q02788 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms