Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RykQ01887 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RykQ01887 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
RykQ01887 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RykQ01887 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RykQ01887 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms