Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms