Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Il6stQ00560 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Il6stQ00560 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms