Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps45P97390 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms