Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1bP97358 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf1bP97358 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1bP97358 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1bP97358 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1bP97358 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1bP97358 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1bP97358 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1bP97358 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1bP97358 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms