Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmsP97355 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmsP97355 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmsP97355 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmsP97355 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmsP97355 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms