Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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