Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctps1P70698 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms