Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms