Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms