Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl23P62830 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms