Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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