Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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