Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga11P61622 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga11P61622 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms