Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms