Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms