Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fermt1P59113 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms