Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms