Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GemP55041 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GemP55041 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GemP55041 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.2 ms