Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc16a1P53986 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms