Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox5P52651 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms