Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms