Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms