Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms