Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms