Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms