Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brca1P48754 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brca1P48754 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brca1P48754 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms