Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms