Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VdrP48281 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VdrP48281 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VdrP48281 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms