Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd4P46935 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms