Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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