Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms