Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms