Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms